文理与工程学院

College of Arts, Sciences, and Engineering：罗切斯特最大的学院，分为文理学院（School of Arts and Sciences）和哈基姆工程及应用科学学院（Hajim School of Engineering and Applied Sciences）两个子学院，设有本科专业和研究生专业。

音乐学院

The Eastman School of Music：是罗切斯特最为著名的学院之一，在美国久负盛名。同时提供本科和研究生两个阶段的教育，包含作曲、音乐理论、音乐表演等专业。

医学与牙医学院

The School of Medicine and Dentistry：罗切斯特大学提供研究生教育和临床教育，位于罗切斯特大学医学中心。

护理学院

School of Nursing：位于罗切斯特大学的医学中心。

伊斯曼口腔健康研究所

Eastman Institute for Oral Health：位于罗切斯特大学的医学中心。

西蒙商学院

William E. Simon Graduate School of Business Administration：作为全美一流的商学院，其金融、会计等专业在全美排名前列。

沃纳教育与人类发展学院

The Margaret Warner Graduate School of Education and Human Development：仅提供研究生教育，位于罗切斯特大学河滨校区（River Campus）。

经济系

Department of Economics：由开创了一般均衡理论的著名经济学家麦肯齐（Lionel McKenzie）创立，长期位居全美前列，曾经是宏观经济学淡水学派的重镇之一。