佛罗里达大学的历史可远溯至西元1853年，当时是位于佛州东部的奥卡拉（Ocala）的州立东佛罗里达高等学校（East Florida Seminary）。后来与佛罗里达农业学院（Florida Agricultural College）合并，直到1905年迁校至甘斯威尔（Gainesville，也称盖恩斯韦尔）并正式定名为佛罗里达大学.1906年开课时学生仅限于男性，至1947年才开放女性入学。
佛罗里达大学的前身是1853年东佛罗里达州立神学院，在19世纪60年代，该神学院与佛罗里达州农业大学合并，1905年经法律允许正式成立佛罗里达大学。作为佛罗里达州最古老、最大和最综合的高等院校，佛罗里达大学是美国学术研究最具多样化的公众大学之一，其正规课程国际教学、研究领域都拥有很长的历史。
